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肿瘤NGS行业新人如何构建自己的知识体系 | 熊言熊语
2022-12-09 · via 熊言熊语

2022-12-10, 1666 words, 6 min read

本文为熊言熊语邮件通讯会员计划内容精选。如果你也是一个行业新人,或许会有一点点启发;如果不是,不妨分享给你身边的行业新人~

关于写作,我曾经看过这样一段话觉得很有道理:写作这件事,短期看冲动,中期看回报,长期看水平。

在硕博6年从事生物信息相关学习和研究后,进入生物医药行业从事肿瘤NGS相关工作过去了一年半。虽然我尽可能地去学习和丰富自己的知识体系,但这仍是一个极其漫长的过程,学习的过程看不到尽头。

想长期坚持就需要有一些更具体的计划。

回顾总结了自己过去一年半的学习过程,整理完参与会员计划读者的调查问卷后,未来一年的更新内容将主要围绕如下5个模块展开。

以下内容既是更新计划汇报,也是肿瘤NGS行业新人如何构建知识体系的一点点参考,分享给你。

通过临床指南了解肿瘤各个癌种

对于医生来说,NCCN、ESMO 和 CSCO 这类官方发布的临床诊疗指南是行医看病的重要参考依据;对于学习或者从事相关专业的人来说,这些指南是很好的搭建基础知识框架的阅读手册。

做项目的时候,养成习惯翻翻最新的临床指南。从中可以快速了解所关心的临床问题,在实际临床应用场景中的进展,顺着指南引用的临床研究和参考文献,就能对相关内容有个基础了解。此外,通过修订说明还能了解发展历程。

因此,我会通过NCCN指南和你一起了解各癌种的临床诊疗现状,更多指南学习方法和思路,会在后续通讯中交流。

基于主题的文献整合解读

关注和了解最新的研究进展是目前的工作所需,更是我自己浓厚的个人兴趣。相信你也一样,只要进入了医学相关的领域,持续学习必不可少。比如每年的各个大会上,都少不了所谓的「继续教育」专场。
从个人的体验来说,如果对于一个细分话题(比如一个重要基因或者生物标志物)仔细阅读学习10篇左右的高分/经典论文,做好横向和纵向类比学习,就可以形成对这个细分话题的基础认知。

因此,我将通过每次3-5篇文献整合解读的方式和你一起学习以下主要四个方面的细分主题:

  • 重要癌症驱动基因的研究进展
  • 重要生物标志物的研究进展
  • 重要临床药物的临床实验进展
  • 重要肿瘤生物学基础问题的研究进展

驱动基因除了关注不同癌种特异性强的基因如肺癌 EGFR,也会关注不限癌种应用的(Tissue-Agnostic)基因如RET。

生物标志物,我们会按照从微观到宏观的尺度(基因突变到基因集再到基因组特征)展开,其中基因组特征包括当下最受关注的ctDNA、TMB、ITH、HRD和新抗原等等。除学习临床应用,还需要会了解它们从提出到走向临床实践再到写入指南的历程。

关注临床以外,我们也应该关注肿瘤相关的各种关键基础生物学问题。对于这些内容,将依据最新版的Cancer Hallmarks 来逐一学习交流。

国内外肿瘤精准治疗头部公司/产品梳理

谈肿瘤精准医疗,了解产业最有效的方式之一是关注国内外头部的那些公司和startup 做过什么、正在做什么和打算做什么。

我大致梳理了以下这些公司,也欢迎你和我一起完善补充(每一封邮件都可以直接回复)。

国内肿瘤NGS检测相关公司

Burning Rock Biotech, Genetron Health, Geneplus ,3D Medicines, OrigiMed ,Genecast ,YuceBio ,Haplox ,GenomiCare ,Singlera Genomics ,GenomiCare ,ChosenMed, Genetron Health

国外肿瘤NGS检测相关公司

Foundation Medicine, GRAIL, Memorial Sloan-Kettering Cancer Center, Myriad Genetics, Natera, Inivata, AnchorDx, Exact Sciences Corporation, Freenome ,Guardant Health ,Thrive Earlier Detection, Veracyte, Invitae ,Oncocyte

国内创新药企

Hengrui Pharmaceuticals, Betta Pharmaceuticals, Suzhou Alphamab Co, Adagene, CStone Pharmaceuticals, Legend Biotech, Zai Lab, Henlius Biotech, Junshi Biosciences, Hutchison MediPharma, Innovent Biologics, BeiGene

国外药企

Abbvie, Pfizer, Novartis, Roche, Bristol Myers Squibb, Merck Sharp & Dohme Corp, Sanofi, AstraZeneca, Takeda, Merck & Co, Daiichi Sankyo, Glaxo Smith Kline, Blueprint Medicines

后续,我会逐一梳理这些头部/创新公司的产品线和药品研发管线,这部分内容感觉适合入行初期的打工人和有意愿进入这个行业临近毕业的学生读者。

国内外肿瘤精准治疗知名机构/医院梳理

类比于打工人关注行业头部公司,作为从事科学研究工作的我们来说,了解最新的学术研究方向和热点,也可以关注研究领域内国内外科研实力雄厚的知名机构和医院。

比如 MSKCC、Dana-Farber 和国内的知名高校及各大附属医院。通过医院进而找到领域内的大牛PI,万一你有机会还能做做博后读读博士呢?

我的个人学习方法和工具介绍

除了以上4个生物医药肿瘤领域相关模块,调查问卷里自由填写感兴趣的话题,很多都指向了学习工作方法、习惯和工具的介绍。

是普遍需求就需要回应,因此在具体信息和知识分享外,也会穿插着详细介绍一些我的个人学习方法和工具,比如读文献读书的方法工具等等,供你参考批评。


本文作者:思考问题的熊

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