组织和血检的一致性比较发了很多文章，不过当组织和血检结果不一致的时候，对患者的预后有什么研究价值呢？

Rosenberg, Shai, Gil Ben Cohen, Shumei Kato, Ryosuke Okamura, Scott M. Lippman, and Razelle Kurzrock. 2023. “Concordance between Cancer Gene Alterations in Tumor and Circulating Tumor DNA Correlates with Poor Survival in a Real-World Precision-Medicine Population.” Molecular Oncology, January. https://doi.org/10.1002/1878-0261.13383.

3 月 25 号 online 在 Molecular Oncology 的一项研究进行了相关的分析。

这篇比较组织和血检一致性的文章，看起来更像是在比较两家不同公司产品的性能。

组织检测的数据来自 FMI ，测序细节:

Mean sequencing depth was >250×, with 100× at >99% of exons.

血检数据来自 Guardant，测序细节是:

The panels utilize hybrid capture followed by NGS of the crucial exons in a panel of 54–73 genes ，5–30 ng of ctDNA was isolated from plasma and complete sequencing at 15,000× read depth。

两者相比，它们能共同分析的基因信息有55个，然后根据收集到的临床数据，就做出了看起来「理所当然」的结论。

组织和血液基因层面较高的一致突变数与更短的总生存期相关。

多变量分析证实，血液和组织中≥2个一致基因水平突变的患者的死亡风险比(HR)为1.49(95% CI 为 1-2.2; P = 0.047) ，而≥3个一致的基因水平突变的患者的 HR 为2.38(95% CI = 1.47-3.87; P = 0.0005)。

也就是说，组织 DNA 和 ctDNA 间的基因突变一致性是一个独立因素，可以用来预测患者生存期。

多想一步。

这个结论很可能意味着：组织和血检不一致的样本，也许其实是血液的ctDNA占比（ctDNA fraction ）偏低导致了突变不一致的发生。

这件事情，去年 10 月 online 在 Annals fo Oncology 的一项研究就是发现了一个和它相关的结果。

其结论显示，plasma ctDNA 占比是在多个癌种中可以广泛应用的血检生物标志物(ctDNA TF)。在多变量分析中显示，ctDNA TF 对预后的影响独立，且当 TF >= 10% 的时候，患者的在CRPC BC NSCLC CRC 这四个癌种中的HR可以达到1.68到3。

再多想一步。

根据这个两个结论，如果组织检出突变，但血检呈阴性，这类患者的预后OS很可能是显著更好的吧？emmm，这个结论对应的研究结果似乎将在2023年的ASCO会议上进行详细报道，作者同样来自于第二项研究的团队。

不过，事情到这里还没有结束。

如果组织和血液突变检测的一致性，ctDNA的肿瘤占比，组织阳性且血液阴性，都可以是预后的生物标志物，那么血检基因的AF本身是不是也单独可以作为一个预后标志物呢？是的，如果仔细研究可能还是用药的预测标志物。

前几天同样发在 Annals fo Oncology 的研究就证明：针对有 BRAF V600E 突变的结直肠癌，血液 BRAF V600E 的 ddPCR 检测结果，在 BRAF V600E AF 2% 分组下，AF 高的患者OS和PFS更差，也更有可能在 BRAF+EGFR+MEK 抑制剂三药联用中获益。

Husain, Hatim, Dean C. Pavlick, Bernard J. Fendler, Russell W. Madison, Brennan Decker, Ole Gjoerup, Christine A. Parachoniak, et al. 2022. “Tumor Fraction Correlates With Detection of Actionable Variants Across > 23,000 Circulating Tumor DNA Samples.” JCO Precision Oncology, no. 6 (November): e2200261. https://doi.org/10.1200/PO.22.00261.

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