http://www.java2s.com/Tutorial/Java/0120__Development/CompileString.htm

import java.lang.reflect.Method;
import java.net.URI;
import java.util.Iterator;
import java.util.NoSuchElementException;

import javax.tools.JavaCompiler;
import javax.tools.JavaFileObject;
import javax.tools.SimpleJavaFileObject;
import javax.tools.ToolProvider;

public class CompileString {
  public static void main(String[] args) throws Exception {
    JavaCompiler compiler = ToolProvider.getSystemJavaCompiler();
    String program = "class Test{" + "   public static void main (String [] args){"
        + "      System.out.println (\"Hello, World\");"
        + "      System.out.println (args.length);" + "   }" + "}";

    Iterable<? extends JavaFileObject> fileObjects;
    fileObjects = getJavaSourceFromString(program);

    compiler.getTask(null, null, null, null, null, fileObjects).call();

    Class<?> clazz = Class.forName("Test");
    Method m = clazz.getMethod("main", new Class[] { String[].class });
    Object[] _args = new Object[] { new String[0] };
    m.invoke(null, _args);
  }

  static Iterable<JavaSourceFromString> getJavaSourceFromString(String code) {
    final JavaSourceFromString jsfs;
    jsfs = new JavaSourceFromString("code", code);
    return new Iterable<JavaSourceFromString>() {
      public Iterator<JavaSourceFromString> iterator() {
        return new Iterator<JavaSourceFromString>() {
          boolean isNext = true;

          public boolean hasNext() {
            return isNext;
          }

          public JavaSourceFromString next() {
            if (!isNext)
              throw new NoSuchElementException();
            isNext = false;
            return jsfs;
          }

          public void remove() {
            throw new UnsupportedOperationException();
          }
        };
      }
    };
  }
}

class JavaSourceFromString extends SimpleJavaFileObject {
  final String code;

  JavaSourceFromString(String name, String code) {
    super(URI.create("string:///" + name.replace('.', '/') + Kind.SOURCE.extension), Kind.SOURCE);
    this.code = code;
  }

  public CharSequence getCharContent(boolean ignoreEncodingErrors) {
    return code;
  }
}

http://www.java2s.com/Tutorial/Java/0120__Development/CompileJavafile.htm

import javax.tools.Diagnostic;
import javax.tools.DiagnosticCollector;
import javax.tools.JavaCompiler;
import javax.tools.JavaFileObject;
import javax.tools.StandardJavaFileManager;
import javax.tools.ToolProvider;

public class CompileFiles2 {
  public static void main(String[] args) {
    JavaCompiler compiler = ToolProvider.getSystemJavaCompiler();
    DiagnosticCollector<JavaFileObject> dc;
    dc = new DiagnosticCollector<JavaFileObject>();

    StandardJavaFileManager sjfm;
    sjfm = compiler.getStandardFileManager(dc, null, null);

    Iterable<? extends JavaFileObject> fileObjects;
    fileObjects = sjfm.getJavaFileObjects(args);

    compiler.getTask(null, sjfm, dc, null, null, fileObjects).call();

    for (Diagnostic d : dc.getDiagnostics()) {
      System.out.println(d.getMessage(null));
      System.out.printf("Line number = %d\n", d.getLineNumber());
      System.out.printf("File = %s\n", d.getSource());
    }
  }
}