记录一下如何在SnapGene中为一段基因组序列，添加多个不同外显子/CDS的完整结构。

这里以拟南芥的序列为例，比方说选择这个由三个外显子（三段CDS）组成的AT4G10310(HKT1)。

首先下载该区域的全长基因组序列，这里简单起见就直接下载TAIR上的，也可以下载别处带有启动子等额外信息的序列，该序列在Sequences部分的full length genomic。

点击进入后在序列底部有Copy Sequence按钮，点击复制序列。

打开SnapGene，选择 New DNA or RNA File，贴入刚刚的序列，选择线性DNA并输入文件名，点击OK确认。

接下来后退页面回到Sequences处，点击full length CDS，进入并复制全长的CDS序列（或者cDNA，按需要来），并到SnapGene中点击左侧的序列比对，将刚刚的CDS序列与基因组序列进行比对。

此时在Map界面能看到CDS的部分比对到了基因组上，内含子区域显示为空缺。

之后点击底部的Sequence，切换到序列面板，从第一个开始比对上的位置（ATG）开始选中序列，一直拖动直到选中最后一个比对上的位置（终止密码子TAA），在顶部点选Feature-Add Feature。

在弹出窗口中随意输入Feature名称（这里我输入了CDS），并在Type处为序列类型选择为CDS，点击OK进行创建。

这样得到的是没有区分出内含子区域的结构，接下来我们为其拆分出内含子。

在序列比对的Sequence界面，从第一个内含子的起始到第一个内含子结束选中序列，再去Feature菜单中选择Create Feature Segment，弹出界面中就会将完整的结构按选中位置进行拆分。

再点击选中内含子区域的片段，按右侧的删除片段，即可创建第一个内含子，重复此过程直到所有内含子都添加完成。

最后构选上Translate this feature in Sequence view，即可将序列按照CDS翻译为氨基酸序列。

记得保存得到的文件，就完成了。