乳腺癌组学资源
本文作者： ForrestGump
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2026-02-08
·
via 一个夏天的年少
乳腺癌蛋白质组学与单细胞组学数据资源汇总
一、蛋白质组学（Proteomics）
1. 肿瘤组织蛋白质组学
| 序号 |
数据 / 文献 |
类型 |
研究对象 |
说明 |
| 1 |
CBCGA 本中心数据 |
蛋白质组 |
乳腺癌组织 |
内部数据资源 |
| 2 |
Breast cancer quantitative proteome and proteogenomic landscape |
蛋白质组 + 蛋白基因组 |
乳腺癌多亚型 |
不同分子亚型的系统性蛋白质组学分析 |
| 3 |
Proteogenomic Landscape of Breast Cancer Tumorigenesis and Targeted Therapy（Cell） |
蛋白基因组 |
乳腺癌 |
肿瘤发生与靶向治疗相关蛋白图谱 |
2. 血浆蛋白质组学
| 序号 |
数据 / 文献 |
类型 |
研究对象 |
说明 |
| 1 |
Proteomic, single-cell and bulk transcriptomic analysis of plasma and tumor tissues unveil core proteins in response to anti-PD-L1 immunotherapy in TNBC |
血浆蛋白质组 + 单细胞 + bulk RNA-seq |
TNBC |
抗 PD-L1 免疫治疗队列，解析治疗响应蛋白标志物 |
二、单细胞组学（Single-cell Omics）
1. TNBC 免疫治疗 / 化疗队列
| GEO编号 |
数据类型 |
样本来源 |
疾病类型 |
说明 |
| GSE169246 |
scRNA-seq + scATAC-seq |
外周血、淋巴结、转移灶（肝脏、胸壁） |
TNBC |
免疫治疗 / 化疗，多部位系统解析 |
| GSE266919 |
scRNA-seq |
原发肿瘤 |
TNBC |
免疫治疗 / 化疗临床样本 |
| GSE266919 |
scRNA-seq |
动物模型 |
TNBC |
小鼠模型，治疗响应机制研究 |
2. 泛乳腺癌单细胞图谱
| 数据 / 文献 |
样本量 |
数据类型 |
研究范围 |
说明 |
| Highly resolved integrated single-cell atlas of human breast cancers |
>100例 |
scRNA-seq |
泛乳腺癌 |
目前最大规模单细胞图谱 |
| Primary Breast Tumor Atlas |
119例 |
scRNA-seq |
乳腺癌 |
部分含免疫治疗疗效信息 |
| GSE300475 |
- |
scRNA-seq |
乳腺癌 |
免疫治疗单细胞图谱 |
| A single-cell map of intratumoral changes during anti-PD1 treatment（Nature Medicine） |
- |
scRNA-seq |
乳腺癌 |
Biokey 队列，抗 PD-1 治疗动态变化 |
3. 肿瘤–淋巴结配对单细胞 / 空间组学
| GEO编号 |
数据类型 |
样本来源 |
研究重点 |
说明 |
| GSE167036 |
scRNA-seq |
肿瘤 + 配对淋巴结 |
免疫微环境 |
肿瘤–淋巴结免疫联动 |
| GSE190811 |
空间转录组 |
肿瘤 + 配对淋巴结 |
空间结构 |
免疫细胞空间组织解析 |
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