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一个夏天的年少

乳腺癌组学资源 焦虑 / 抑郁相关多组学研究资源 【转载】单细胞数据的统计分布 表格:乳腺癌复旦分型 综述摘要:乳腺癌的分型策略 【转载文章】影像组学的研究思路 文献阅读:单基因的研究思路 常见的随机变量分布 文献阅读:自上而下描述肿瘤发展的时空动力学 LINGER:从单细胞多组学数据推断基因调控网络 产科学疾病诊断 心电图基础参数 耳鼻咽喉头颈外科学主要知识总结 口腔科学总结 医学心理学总结 卡尔·马克思:青年在选择职业时的考虑 回忆杀——初中的随笔 朴素贝叶斯法 深度学习笔记(十):批量归一化
表格:乳腺癌复旦分型
本文作者: ForrestGump · 2024-09-22 · via 一个夏天的年少

表格

基于受体的分型

分子分型

转录组特征

基因组特征

代谢组特征

潜在靶点

临床

TNBC

Basal-like and immune-suppressed (BLIS)

  1. 细胞周期基因上调
  2. DNA损伤修复基因激活
  3. 免疫应答基因下调
  1. 突变:TP5377%);富集同源重组缺陷(HRD)特征
  2. CNAs:高的染色体不稳定性9q2312p13扩增
  1. Low HRD:强化化疗
  2. High HRD:铂类化疗药

5RFS84%

Immunomodulatory (IM)

  1. 免疫细胞激活
  2. 细胞因子相关基因高表达
  1. 突变:TP5381%);富集同源重组缺陷(HRD)特征
  2. CNAs相对高的染色体不稳定性

ICB

5RFS94%

Luminal androgen receptor (LAR)

亚洲人群最常见的TNBC亚型

雄激素受体激活

  1. 突变:TP5361%),PI3K-AKT~70%),ERBB29%
  2. CNAsCDKN2A/B丢失,8p12缺失,低CIN,低HRD
  1. 内分泌治疗
  2. ERBB2拮抗剂、CDK4/CDK6拮抗剂

5RFS88%

Mesenchymal-like (MES)

乳腺干细胞激活

突变和CNAs介于LAR和余两组之间

靶向肿瘤干细胞(STAT3抑制剂)

5RFS79%

HR+/HER2-

Cranial luminal (SNF1)

富集雌激素受体通路

  1. 突变:PIK3CA51%);TP5311%
  2. CNAs:无特殊

磷脂代谢上调PIP5K1APIK3CG

内分泌治疗

预后最好

Immunogenic (SNF2)

富集免疫激活通路

  1. 突变:PIK3CA37%)、TP5335%);
  2. CNAs无特殊

磷脂代谢上调PIP5K1APIK3CG

ICB

低表达ER

Proliferative (SNF3)

富集雌激素受体通路

富集细胞周期通路

  1. 突变:TP5338%)、PIK3CA36%);
  2. CNAsCCND1FGFR1MDM2扩增HRD,染色体不稳定

失调通路最多

CDK4/CDK6拮抗剂

PARPi

Ki-67

RTK-driven (SNF4)

富集RTK通路

  1. 突变:PIK3CA37%)、TP5327%);
  2. CNAsCCND1FGFR1MDM2拷贝数增加;HRD,染突变:PIK3CA37%)、TP5335%);

失调通路最

RTK抑制剂

预后最差

HER2+

Classical HER2 enriched (CLA)

富集一碳代谢途径和ERBB2相关通路

富集APOBEC特征

  1. TMB最高
  2. ARID1A突变

碳氢化合物代谢途径

HER-2拮抗强化治疗

Immunomodulatory (IM)

富集免疫相关通路

富集APOBEC特征

降阶化疗

ICB

Luminal-like (LUM)

富集雌激素受体途径

  1. LUMPIK3CA突变率最高(49%)【该突变和在ER+中流行】
  2. CCND1ZNF217扩增【基因在ER+高表达】

脂代谢(和ERPI3K有关)

内分泌治疗

基因突变较多可考虑CDK4/CDK6

Basal/Mesenchymal (BM)

富集RTK通路

富集细胞外基质和多种致癌通路

RTK拮抗剂

参考文献

Genomic and Transcriptomic Landscape of Triple-Negative Breast Cancers: Subtypes and Treatment Strategies - PubMed (nih.gov)

Molecular classification of hormone receptor-positive HER2-negative breast cancer - PubMed (nih.gov)

Molecular Characterization and Classification of HER2-Positive Breast Cancer Inform Tailored Therapeutic Strategies - PubMed (nih.gov)