1 立场上的区别

首先请大家想一想为什么化学专业的学生直接学习生物化学会感到别扭？

根本原因是立场不同。化学专业的人必然要在化学知识的基础上看待生物；生物专业的人必然要站在他所学生物知识的基础上看待化学。

生物化学是生物学家探索化学世界，站在生物学研究的对象——生命体的立场上；化学生物学是化学家探索生物世界，站在化学研究的对象——化学物质/分子的立场上，这就是立场的不同。

2 观点和方法上的区别

其次是观点不同。化学家和生物学家都想利用化学的理论方法为工具作一些事情，但是他们对如何利用这个工具有不同的看法。

生物化学以生命体为起点寻找生命活动在分子层面的解释，希望弄清楚是什么的问题，更具有解释性；而化学生物学以分子为起点寻找分子参与和调控生命活动的机制，希望弄清楚为什么和怎么做的问题，更具有创造性，这就是两个学科因立场不同导致的观点上的不同。

并且我们可以看出，化学生物学的研究方法倾向于自下而上，从简单到复杂；而生物化学恰恰相反，是一个从复杂的生命活动开始自上而下的研究过程。

3 研究内容的区别

所以观点不同导致方法不同。方法的不同导致研究内容的差别。首先讲生物化学。生物化学希望研究生命现象，阐明生命活动的变化规律，所以要寻找生命活动的承担者、遗传物质的携带者，还有生物体的新陈代谢机制，这就把研究中心放到了生物大分子，也就是核酸、蛋白质上，研究它们的结构功能、相互是如何作用的。在此过程中，生物学家们研制出了多种生物制品。再往下走，会涉及到代谢中的氧化、降解等涉及到小分子的部分，酶在其中起到了至关重要的作用，所以也要对酶的作用机理做研究。

至于化学生物学，它必然要继承化学的基本理念，也就是研究物质的变化规律，放在生命层面上，就是要阐明生命活动的根本原理，并且是从小分子开始的。对于具有生物活性的小分子的合成和其与生物大分子之间的作用机制、调控方法是生物化学中很少涉及的内容，同时也是化学生物学的重点研究内容。我们注意到两者都会研究作用机制，但化学家希望做的更多——希望灵活的进行调控、修饰，作一些创造性的工作。在此过程中很多化学药物被研发出来。同时，化学生物学还致力于研究化学物质对细胞功能的调控，以间接或直接实现对生命活动的调控。

总的来说，我们可以看到化学生物学和生物化学采取了两种方向相反的研究方式。

综上所述，两个学科立场不同、观点不同、方法不同、研究内容不同。