“区块链是一个分布式的总账，通过总账（ledger）来达到全局信息的共享。但是，总账就意味着数据量本身的巨大，而分布式又意味着超高的冗余度，因此就会带来可扩展性（scalebility）的问题。”

2.共识机制不够完善

对于区块链技术中的共识算法现在已经提出了多种共识机制，最常见的如PoW、PoS系统。但这些共识机制是否能实现并保障真正的安全，需要更严格的证明和时间的考验。

3.51%攻击

在比特币中，如果一个人控制节点中绝大多数的计算资源，他就能掌控整个比特网络并可以按照自己的意愿修改公有账本。这被称为51%攻击，一直是比特币系统中受到诟病的设计之一。
即便这还是一种理论上的假想，这种51%攻击会很有机会。由于真实的区块链网络是自由开放的，所以区块链网络上没有一个管理员能够阻止拥有足够多计算资源(实际上会需要花费很多资源)的人做任何事情。

4.性能问题有待突破

从目前的情况看，区块链的性能问题主要体现为吞吐量和存储带宽的矛盾。
以比特币为例，在公有链中，每秒7笔的处理能力远不能满足整个社会的支付需求；同时，比特币全部交易数据目前已经接近80G，对于普通电脑的存储来说，这是个不小的负担。如果只是简单提高区块大小来提高吞吐量，比特币很快就变成只有少数几个大公司能够运行的系统，有违去中心化的设计初衷。在比特币、以太坊等公有链系统中，上述矛盾是系统设计时面临的最大挑战。

5.隐私保护有待加强

传统上数据是保存在中心服务器上的，由系统运营方保护数据隐私。但在公有链中，没有中心化的运营方，每一个参与者都能够获得完整的数据备份，这也意味着公有链的数据库是透明的。
如果区块链需要承载更多的业务，比如实名资产，又或者通过智能合约实现具体的借款合同等，这些合同信息如何保存在区块链上，验证节点在不知晓具体合同信息的情况下如何执行合同，这就需要关注同态加密、零知识证明等新型密码学方案在区块链问题上的应用进展。

6.分叉问题

与中心化系统的升级方式不同，在公有链中，因为节点数量庞大，参与者身份匿名，不可能关闭系统集中进行升级。在具体实践中，公有链社区摸索出了“硬分叉”和“软分叉”等升级机制，但遗留问题有待观察。此外，由于公有链不能“关停”，其错误修复也异常棘手，一旦出现问题，尤其是安全漏洞，将非常致命。

7.人才匮乏

破解区块链人才培养是一个难题。区块链技术从诞生开始就迅猛覆盖了数字支付、大数据、版权保护等多个领域，但是区块链人才资源严重不足，制约了区块链行业的高速发展。
但是与区块链技术的火热相比，人才极度匮乏已成为区块链行业发展的主要瓶颈之一。将区块链技术在资本市场中投入到实际应用中，需要建立基于区块链技术的全新系统，就必然是对双方都有深刻了解的跨界人才。可是当前市场缺少大量既了解区块链技术，又了解金融的多方面人才。 

8.不可篡改、撤销