https://www.nature.com/articles/s41588-026-02634-7 [!abstract]+ 克罗恩病 (CD) 是一种慢性炎症性肠病，其临床表现和治疗反应具有显著的异质性。为了探索其分子机制，我们构建了 IBDverse 数据库，这是一个包含大量末端回肠活检样本的单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 数据集，分析了来自 111 例 CD 患者和 232 例健康对照者的超过 110 万个细胞。该数据库整合了发现队列和验证队列，用于可靠地鉴定 CD 相关细胞类型、基因和通路。我们发现，在宏观炎症消退后，主要组织相容性复合体 I 类分子在干扰素驱动下上调，并持续存在于祖细胞中，这标志着上皮细胞发生了改变。ITGA4+ 巨噬细胞被鉴定为关键的炎症驱动因子，表现出 JAK-STAT 信号通路和细胞因子（白细胞介素-6 (IL-6)、IL-12 和 IL-23）表达的增强。遗传力分析将炎症性单核细胞和巨噬细胞与克罗恩病易感性联系起来，表明驻留和募集的免疫细胞参与了该病的发病机制。这些发现为克罗恩病构建了一个全面的细胞和分子框架，为深入了解疾病机制和...